Le elezioni si svolgono il 16 aprile 2000. Vasco Errani è il primo presidente della Giunta eletto direttamente dai cittadini in base alla legge costituzionale n° 1 del 21 novembre 1999.

La Giunta è l'organo di governo della Regione e viene nominata dal presidente entro sette giorni dalla data in cui è stato proclamato eletto.
Il presidente può scegliere gli assessori sia all´interno dell´Assemblea legislativa, fra i consiglieri regionali eletti, che all'esterno.

Il 22 maggio 2000 vengono nominati i componenti della Giunta regionale.
L'atto di nomina è il decreto del presidente n. 216 del 22 maggio 2000 che specifica anche le deleghe degli assessori. Il decreto del presidente n. 879 del 22 maggio 2000 affida invece l'incarico speciale di consigliere alla Presidenza ad Alfredo Bertelli

Presidente

Vasco Errani  (Ds)

Assessori

Vera Negri Zamagni (Indipendente)
Vice Presidente, assessore alla Cultura, Sport. Progetti per i rapporti con i cittadini
Mariangela Bastico (Ds)
Assessore alla Scuola, Formazione professionale. Università. Lavoro. Pari opportunità
Giovanni Bissoni (Ds)
Assessore alla Sanità
Gianluca Borghi (Verdi)
Assessore alle Politiche Sociali. Immigrazione. Progetto giovani. Cooperazione internazionale
Marioluigi Bruschini (Pdci)
Assessore alla Difesa del suolo e della costa. Protezione civile
Armando Campagnoli (Ds)
Assessore alle Attività Produttive. Sviluppo economico. Piano telematico
Flavio Delbono (I Democratici poi D.L. - La Margherita)
Assessore alle Finanze. Organizzazione. Sistemi informativi
Alfredo Peri (Ds)
Assessore alla Mobilità e Trasporti
Guido Pasi (Rifondazione Comunista)
Assessore al Turismo e Commercio
Pier Antonio Rivola (PPI poi D.L. - La Margherita)
Assessore alla Programmazione territoriale. Politiche abitative. Riqualificazione urbana
Guido Tampieri  (Ds)
Assessore all' Agricoltura. Ambiente e Sviluppo sostenibile
Luciano Vandelli  (Indipendente)
Assessore all'Innovazione amministrativa ed istituzionale. Autonomie locali

Consigliere alla Presidenza:
Alfredo Bertelli

Il 20 dicembre 2002 la vice presidente della Giunta regionale Vera Negri Zamagni si dimette. La carica di vice presidente è assunta da Flavio Delbono; le deleghe alla Cultura, Sport. Progetti per i rapporti con i cittadini da Marco Barbieri, che viene nominato assessore (decreto del presidente n. 364 del 20 dicembre 2002). 

Il 22 dicembre 2012 viene nominata la nuova Giunta.

Presidente

Vasco Errani  (Ds)

Assessori

Flavio Delbono (I Democratici poi D.L. - La Margherita)
Vice Presidente. Assessore alle finanze. Organizzazione. Sistemi informativi. Controllo strategico
Marco Barbieri (PPI poi D.L. - La Margherita)
Assessore alla Cultura, Sport. Progetti per i rapporti con i cittadini
Mariangela Bastico (Ds)
Assessore alla Scuola. Formazione professionale. Università. Lavoro. Pari opportunità
Giovanni Bissoni (Ds)
Assessore alla Sanità
Gianluca Borghi (Verdi)
Assessore alle Politiche Sociali. Immigrazione. Progetto giovani. Cooperazione internazionale
Marioluigi Bruschini (Pdci)
Assessore alla Difesa del suolo e della costa. Protezione civile
Armando Campagnoli (Ds)
Assessore alle Attività produttive. Sviluppo economico. Piano telematico. Patti territoriali
Alfredo Peri (Ds)
Assessore alla Mobilità e Trasporti
Guido Pasi (Rifondazione Comunista)
Assessore al Turismo e Commercio
Pier Antonio Rivola (Ppi poi D.L. - La Margherita)
Assessore alla Programmazione territoriale. Politiche abitative. Riqualificazione urbana. Disciplina generale dei lavori pubblici e Osservatorio sugli appalti
Guido Tampieri  (Ds)
Assessore all'Agricoltura. Ambiente e Sviluppo sostenibile
Luciano Vandelli (Indipendente)
Assessore all'Innovazione amministrativa ed istituzionale. Autonomie locali

Consigliere alla Presidenza:
Alfredo Bertelli

Col decreto del presidente n. 230 del 1 settembre 2003 viene affidato l'incarico speciale di capo di Gabinetto del Presidente della Giunta all'On. Bruno Solaroli.